l'histoire se passe dans les années 1910-1916 (si je me rappelle bien) dans un autres monde ou la science est remplacée par l'alchimie dont la loi de base est l'échange équivalent.

Deux frères Alphonse(9ans)  et Edward(10ans) Elric sont deux jeunes prodiges qui vivent avec leur mère Tricha Elric leur père ayant disparu à coté de la maison de leur meilleure amie Winry Rockbell qui vit avec sa grand-mère Pinako Rockbell (et elles sont toutes les deux des genies des mekagreffes) leur mère qui souffrait d'une grave maladie (desespoir) en secret en mourut. Un an plus tard,il essayairent un interdit: la transmutation humaine n'ayant jamais été réussie elle fut interdite car elle est trop dangereuse.seulement ils l'essayairent et le prix à payer fut une jambe pour edward et son corp et son ame pour alphonse; seulement edward tenant à son frere plus que toute chose sur terre a sacrifié son bras (alors qu'il etait meme pret  à sonner son coeur) et a reussi à mettre l'ame d'Al dans une armure  s'ensuit alors la quette pour chercher la pierre philosophale et qu'ils puissent retrouver leurs corps.